Орнитологическая экспертиза исследует птиц, птичий пух, перо, ткани и органы птиц, а также их фрагменты.
Особенности выполнения орнитологической экспертизы зависят от обстоятельств, в которых возникла необходимость ее применения.
Ситуации, в которых бывает востребована орнитологическая экспертиза, как правило, связаны с расследованием экологических преступлений или с поиском доказательств в процессе ведения уголовных дел, касающихся преступлений против птиц, такие как: браконьерство, незаконная охота, жесткое обращение с животными.